Лётная история аэропорта «Манас» начинается с 4 мая 1975 года, когда был открыт первый регулярный рейс № 613-614 по маршруту Москва «Домодедово»-Фрунзе «Манас». Именно эту дату принято считать днем рождения главной воздушной гавани республики.
Имя «новорождённому» аэропорту дал известный писатель Чингиз Айтматов, в честь великого героя кыргызского эпоса «Манас».
В 1992 году указом президента КР авиационная гавань вошла в состав Национальной авиакомпании «Кыргызстан Аба Жолдору».
В 1993 году произошло знаменательное событие – Кыргызстан стал полноправным членом Международной организации гражданской авиации (ICAO – International Civil Aviation Organization). Аэропорт «Манас» также является членом Международного Совета Аэропортов (ACI – Airport Council International) и включен в состав правления Ассоциации «Аэропорт», что повышает его статус среди аэропортов евразийского пространства.
В 1994 году открывается первый международный рейс Бишкек-Стамбул.
Сегодня аэропорт способен принимать все типы воздушных судов, располагает одной из лучших ИВПП в регионе. Маршруты перевозок охватывают страны Европы, Азии и Ближнего Востока.
Цель деятельности всех служб аэропорта – максимальное сокращение продолжительности операций по приёму-отправке пассажиров, багажа, обработке грузов и по обслуживанию авиатехники при безусловном соблюдении требований авиационной безопасности.